《某科学的超电磁炮S特典》讲述发生在面积占据东京都西部的三分之一，居住着230万名人口，其中八成人口是学生的巨大都市学园都市。学园都市和外部隔离，研究最尖端科技。所有学生都接受超能力开发，并大都借由药物、催眠术与通电刺激等方式取得超能力。 本剧为同名TV动画的特典，故事依然围绕着四位萌点满满的主角的日常展开。